La Fondation Melipona Maya est engagée dans une double mission : valoriser le patrimoine productif et culturel des communautés Maya par la renaissance de la méliponiculture. 
Il s'agit d'abord de développer de nouvelles techniques d’élevage des abeilles mélipones, qui permettent de produire un miel pur, de réaliser des divisions et ainsi, de multiplier les colonies.
Ils travaillent aussi avec les communautés Maya qui participent à cette renaissance, au nom de leur héritage culturel et pour le développement d'un nouveau modèle économique.